>>620-621
うちは以前から ftp の方を使っていたけど同じ現象が起きた。
で、リストの中になぜか二つ jaist の ftp サイトが出てきたのでもう一つの方を選んだらいけた。
で、今セットアップのフォルダを確認したら

>dir ftp*
2007/01/09 17:39 <DIR> ftp%3a%2f%2fftp.jaist.ac.jp%2fpub%2fcygwin
2008/06/11 13:40 <DIR> ftp%3a%2f%2fftp.jaist.ac.jp%2fpub%2fcygwin%2f

どうやら今使える方は末尾に "\" が付いているみたい