vi でも Esc たたくので気にならないなぁ。

TeraTerm のヘルプには、

>メタ・キー (Meta key)
>
> [Setup] KeyboardでMeta keyを選択すると、VTWindow で Alt キーをメタ・キーとして使うことができます。
>例えば Alt+A を押すと、ESC A を送出します。メタ・キーモードでは、Alt キーを使うショートカット・キー(Alt+C 等)は使用できなくなります。

とかいてます。

Cygwin スレなので,、これ以上は TeraTerm うんぬんは
どこかでおねがい。