>この時.cshrcのSCIM関連の環境変数をコメントアウトしたりもしたんですが
同様の反応でした。
確認
% grep [Ss][Cc][Ii][Mm] ~/.*

も一つ
% echo $GTK_IM_MODULE $XMODIFIERS $LANG

あと
% grep scim /usr/local/etc/gtk-2.0/gtk.immodules