最近の環境ならprintf外部コマンドがあるんじゃない?
mv `printf %02d $COUNTER`.jpg /home/more

なければ
mv `echo "0$COUNTER" | sed 's/0*¥(..¥)$/¥1/'`.jpg /home/more
とか、
mv `echo "0$COUNTER" | rev | cut -b1,2 | rev` /home/more
とか。