plot "xaa" using 0:1, "" using 0:(a=$1+$3) axes x1y2, "" using 0:(-(b=$2+$4)) axes x1y2, "" using 0:(a-b) axes x1y2
こういう書き方できないんだね。当たり前って言えばそうなんだけどさ。
gnuplotがもう少し速く計算してくれたら2回書いても遅くならないんだが…