スレの上の方で半角カタカナが mule-unicode になってしまっていたものです。
emacs CVS 先っぽにしてみたからなのかよくわかりませんが、

(setq-default translation-table-for-input nil)
ではなく
(setq translation-table-for-input nil)
としてみたところ、
なんと「*scratch* だけ」半角カタカナが katakana-jisx0201 になりました。

character: ｵ (3253, #o6265, #xcb5, U+FF75)
charset: katakana-jisx0201 (Katakana Part of JISX0201.1976.)
code point: #x35

この Navi2ch の書き込みバッファや、
他のファイルを開いたときのバッファでは相変わらず mule-unicode になっています。

*scratch* だけというのがどういう状況なのかわかりませんが一応報告まで。
# まだ emacs スレには質問していません。