>>440
お騒がせしたので答えてみる…。

>一定時間ごとにroot宛にrootからメールが届く（チャーリーさん@自分のホスト名）
メールはそのままプログラムからrootへのメールで、デフォルトだとperiodicが
日毎、週毎、月毎にレポートを送ってくる。
いらなかったら、/etc/crontabのperiodic関連のエントリを全部コメントすればいいかも。

>ＦＴＰクライアントからのファイル操作がパーミッションを理由にはねられる
ファイルを作成したのがrootなのにFTPでログインしているユーザが一般ユーザだとか？
そうならrootでコンソールとかから入って、問題のファイルをchownコマンドで所有者を正しくする。

>shutdown
shutdown -p now で落ちると思う。