言うまでもありませんが確認にために触れておくと
GNU/Linux と FreeBSD との決定的な違いはカーネルとシステムの親和性にあります。
前者は所詮は寄せ集めで、後者は開発コード管理の時点から一貫性を維持しています。
それが安定稼働と因果関係があるかどうかについては言及しませんが。