少なくとも、

RPMにするのかconfigure-make-installになるのか
インストールしたアプリはどこに行くのか
参照するライブラリはどこにあると定めてあるのか
無駄に多いフォルダを廃して全てのログなど同系列のものは同じフォルダに

これに関する取り決めが出来て完全に統一されれば
ハードウェアベンダも積極的に周辺機器を出すし
ドライバ書くほうも非常にラクになる