IMAP のフォルダを .folders に %/ と書いておくと全て取得してくれますが、
これが
%INBOX.Fuga.A
%INBOX.Fuga.B
%INBOX.Fuga.C
とすべて同じ階層で表示されますが、これを

Fuga {
%INBOX.Fuga.A "A"
%INBOX.Fuga.B "B"
%INBOX.Fuga.C "C"
}
のように、%INBOX.Fuga. の階層の中に A, B, C がいるように
設定する事はできますか？

.folders に全て書けばいいのだろうと思いますが、
IMAP のフォルダ構成に変化があった時に、常に .folders を
修正するのは面倒なので、何かよい方法があれば
アドバイスを頂けないでしょうか？