上書きインストールって奴やったことないんだけど
やることっていったら
/etc の変わったファイルの上書きと以前の/etc のバックアップ
/bin の上書き(バックアップある？

そんくらいじゃないの？

あ、カーネルとかもかえるか。
なぜか俺のマシンは1年置き位にHDDがクラッシュするから新規インストール以外したことないや