apache 2.0.53 です。

Nucleus (PHP + MySQL) を動かしているのですが、あまりにも遅いので
ボトルネックがどこなのかを探りたいのですが、どのように調査すべきか
わからないのでアドバイスをください。

通常の HTML (Document Length 4085 Byte) を表示する場合、
ab -n 1000 -c 10 http://example.jp/index.html を行なった結果で、
Request per second: 305.85 [#/sec]

程度なのですが、これを Nucleus にしたところ、

ab -n 1000 では timeout になってしまうので、

ab -n 10 -c 10 http://example.jp/blog/index.php にて計測すると
Request per second: 0.18 [#/sec]

と極端にスループットが落ちます。

どこから手をつけるべきでしょうか？ 調査するよきアドバイスがあれば
よろしくお願いします。