あと、チューニングで速度を計測する場合におすすめのソフトとかありますか？
一応、Win側からのファイル転送にはHDBENCHやファイラーからの転送とシステムモニタを使ってます。
HDBENCHのランダムリードはキャッシュが効いてしまうので意味がありませんが。

ログが残せたり、ランダムリードライト、1KB〜50MBの個々のファイル転送、
複数同時転送、こういった事が一括で出来るようなソフトがあればと思います。

あと、UNIXサーバ側のHDDベンチには何を使ってますか？