実況状態ですみませんが。
リブートしたところ、いろんなアプリが動かなくなりますた…orz

/usr/src/UPDATINGの20040728、語ろう・モアを読んだところ、
C++を使うものは全部作り直しということでつね。

chmod 0 /usr/lib/libstdc++*で動かなくなったものを全部作り直せとかありますが、
なかなかそうも行かないようで。
シロウトは何も考えずportupgrade -Rafするのがいいね…。