portsで使われるperlの設定が切り替わってない。
use.perl system
use.perl port
とすれば/etc/make.confの設定が書き換えられるはず。
その後で portupgrade -f "p5-*" とでもしてperlモジュールを更新すれば
新しいperlを使うようになるんじゃないかな。

/usr/ports/UPDATINGに何か書いてなかったっけ?