まず、
1:ディスクトップに置いといて、
2:無秩序さが気になりだしたらマイドキュメントに使わなそうなファイルを
  押し込んでディスクトップを整理する
3:マイドキュメント内のファイルでまた使ったらディスクトップへ復帰
4:マイドキュメントの中の無秩序さが気になりだしたら日付フォルダを作って
  マイドキュメントの中をその日付フォルダへ移動。
5:日付フォルダ内のファイルも使ったらディスクトップへ復帰
こんな感じか。時間軸でのダブルバッファ(?)で整理してる