超整理法だったかな?時系列で整理するってやつ
あれを参考にして
1:デスクトップである程度管理する
2:ある程度フォルダが増えたら古いやつからマイドキュメントの中の
  大まかに分類したフォルダへ移動
3:検索等で「役に立った」と思うファイルが見つかった場合、
  そのファイルとそのグループの更新日付けを新しくする

これでなんとなく整理してる。GoogleDesktopSearchも日付順で
表示してくれるから助かってる