venti への書き出しが終わってないのかも。
fossilcons で fsys main df すると、どのくらいの容量を fossil が
使ってますか?

venti へきちんと書かれた後だと、
main: 5,701,632 used ...
みたいな感じで、10MB も使っていないはずです。これが 300MB 使用中
とかでると、venti への書き出しが完全には終わってなくてがりがり
いってるのかもしれません。しばらくほっておいてみては?