自分はメモのタイトルに
[仕事]とか[PC関係]とか[その他]とか
分類のキーワードを書くようにしてます。
（もちろん .howm-keys に登録しておく）
で menu.howm の先頭に
[仕事]
[PC関係]
みたいにグループを列挙しておいて、
絞り込みたいキーを選んでリターン。

グループを変えたいときは一度メニューに
戻る必要があるけど、頻度的に問題ないかと。