Cygwinが遅いってどこが・・・
bashなんて１秒もあれば立ち上がるじゃん
configureだってlibtoolizeされたテンコ盛りスクリプトでも
素のUNIXの２〜３倍の時間で済むよ
つか、遅い遅い言ってる奴はそんな速度が問題になるような
プログラムをCygwin上で動かしまくってるのか？
UNIXの代わりに使おうとして逆切れしてるだけのアホにしか見えんのだが・・・