Vmware
利点：本物のUNIX環境である。バックアップが簡単。
UNIX用のプログラムは全部使える。
欠点：起動が面倒。Windows側との連携が面倒。
有料。IPアドレスが複数無いとNAPTになる。

Cygwin
利点：タダ。お手軽。フォントが綺麗。
Windows側との連携が簡単。
欠点：遅い。コンパイルできないものが多い。
UNIX初心者には使いこなせない気がする。