jarファイルダウンロードしてくる部分のこと？
yum(rpm)、gemとかと一緒だね、
leiningenとかで使ってるのは、javaのmavenレポジトリがベース
rubygems.orgとか良くダウンしてたので、その時の為に、ローカルにリポジトリのhttp://daly.axiom-developer.org/clojure.pdfミラー作ったり、yumもインストールCDからしたり出来るし。ローカルネットワークのみの場合でもproxy経由でインストールしたりする。

mavenは詳しくわからないけど、
leiningenも、ローカルにミラーしたmavenレポジトリ追加したりということは可能かと。
あとは、独自版を使いたいときのために、localinstallプラグインというのがある。