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透過的トランザクションは対応してる。
S2Hibernateのソース読むとわかるけど、S2Hibernate自体はあんまりたいしたことはして
なくてSessionとSessionFactoryへのBridgeをしてるだけ。
Springみたいなサポートクラスはないのは少し残念。

両方使ってみたけどもORMとの組み合わとからいろいろとSpringの方が便利だな。
プレゼンテーションとかの連携もこれからみたいだし。
他のフレームワークとの連携度でみるとSpringが一歩抜け出してると思われ。
Spring>Pico>Seasar
という感じだけど、どう？

ただ、Seasarは敷居が低いんで、IoCはこれから始めるっていう人にはかなりいいと思う。