「本願寺との連携による美濃侵攻は決して絵空事ではなかったのである。」

小学生レベルの国語力があればこの記述は
絵空事ではない＝拠点があったという事実があった
となり、何の根拠もなく本願寺と連携すると考えていたわけではない
と解釈できます

そこから本願寺門徒が美濃に侵攻することができたというのは飛躍し過ぎでそれは無理があるという表現でもありますね
「絵空事ではない」

そこまで筆者が考えているとしたら
「実現できる」とか「十分可能」のような表現になります