史実に近い形で勝利なら、上杉毛利は保々無傷って事ですからね。
ならば、発言力を確保する意味で東軍大名の半分くらいは本領安堵で味方に組み込みたいでしょう。
別に、当主を隠居させて西軍寄りの一門に当主の首を挿げ替えるとか手は有りますし。
全部潰すと、逆に豊臣系の大名領地が減って統制取れない気がしますし。