ごめんなさい、環境書くの忘れてました。

FreeBSD4.8-RELEASE-p3
libtool 1.5
automake 2.53
autoconf 1.5
そんな感じです。
全部portsで入れてます。

--no-verifyで引っかからなかったのは、
やっぱりlibtoolのバージョンっぽいですね。