すみません。原因はコード戻していったところわかりました。
PDOStatement::executeメソッドをexecとしてトランザクション中に実行してそんなメソッドないとFetal Errorが出てました。
どっちみちエラーでトランザクションを正常終了できなかったために起きた現象のようですが、
Apache再起動以外に何か解決方法はあるのでしょうか？
詳しい方教えてください。