経験談ですが、ターゲットが日本人向けのサイトなら
yii-userの特定のクラスをextendsしようが
ファイルの中身を直接修正しようが、リスクはかなり大きいと思いますよ?

あと、ファイルの中身を直接修正するということは
yii-userがバージョンアップしても
それを使えない、もしくはextendsするより修正のリスクが大幅に上がることを考慮しないといけませんよ