見た感じ問題なさそうだなぁ
なんとなくeclipse側の気がする
ポート9000 で通信してるかとか確認してみるのがいいかも

可能ならphp/xdebug vc9ビルドを試してみるとか
xdebug は結構不安定だったりするからver変えてみるのもいいかも