質問ですが、数百万件規模のデータをGAE上で日々集計してレポート形式で表示する、
といった要件にGAEは向いているのでしょうか?

少し調べた範囲だとタスクキュー使ってデータ分割しながら集計すれば
やれなくはなさそうですが、厳しいですかね?