mbstring や oci8 の定数も同様に比べてみたところ、これらは
cliでもモジュールでも定数として見えました。

SQLiteのモジュールの定数だけがおかしいみたいです。
なんなんだろう。。。
Debian(php5-sqlite)の問題だったらごめんなさい。