ユーザー関数は、あちこちのページで使い回すから当然別のファイルにして、その都度インクルードとかするでしょ。

index1.php
↑インクルード
user_func.txt
↓インクルード
index2.php

でもこうなるとindex1.phpにアクセスするということはuser_func.txtにもアクセスする事になるので、鯖に負担がかかる。呼び込むファイルが増えればなおさら。

負荷を無くすにはどうしたらいいでしょうか？

個人的にできたらいいなと思うのは、この様な自作関数もメモリ上に置けるようにしてほしい。
最初に鯖を立ち上げた時に読み込んで後は元々ある関数みたいに使いたい。