皆さんありがとうございます。

何度も申し訳ないのですが、書き込みを参考にして以下のようなコードを書き、
実行したところ、出来上がったファイルはなぜか最終行がかぶってしまいます。
どこかおかしなところがあれば指摘していただけないでしょうか？
ファイルの内容は>>617と同じ状態です。

$filename = "test.txt";
$delword = "cba";
$handle = fopen($filename,"r+");
flock($handle,LOCK_EX);
$contents = fread($handle,filesize($filename));
$lines = explode("\n",$contents);
$del = array_search($delword,$lines);
unset($lines[$del]);
$line = join("\n",$lines);
rewind($handle);
fwrite($handle,$line);
flock($handle,LOCK_UN);
fclose($handle);