PHPでHTMLを動的生成させており、外部のJavaScriptファイルを
ヘッダで読み込んでいるのですが、その外部JavaScriptのソースを
HTMLを吐きださせているPHP側から制御したいと考えています。

今は外部JavaScriptのソースを呼び出す時に、

JavaScript.php?val1=hoge&val2=hoge

の様にしてURLから変数を渡しているのですが、出来ればURLからの変数受け渡しは避けたいと考えています。
HTML側に直接JavaScriptソースを書き込む以外に、URLからの変数受け渡しを避ける方法は何かありませんでしょうか？

宜しくお願いします。