Attributes.Addよりも>>642が教えてくれたように
OnClientClickプロパティにJavaScript書く方がスマートだね。

で，ちょっと実験してみたけどAttributes.AddでもOnClientClickでも
確かに＆amp;にエンコードされる。
けどどちらにしてもtypeの値は正しく取得できたよ？

以下，テストに使ったコードのサンプル
(インデントは全角スペースに置換したため注意)

protected void Page_Load(object sender, EventArgs e)
　　{
　　　　//以下の2行はどっちでも同じHTMLを出力される
　　　　//Button1.Attributes.Add("onclick", "window.open('Default.aspx?id=0&type=test');");
　　　　Button1.OnClientClick = "window.open('Default.aspx?id=0&type=test');";
　　　　
　　　　//GETパラメータの全てのキーと値をタイトルに設定
　　　　foreach (string key in Page.Request.QueryString.Keys)
　　　　{
　　　　　　Page.Title += ":" + key + "=" + Page.Request.QueryString.Get(key);
　　　　}
　　}

ボタン(Button1)一個貼り付けて実行してみればわかるかと。