797さんの説明どおりやってみたところ、手動でphpを実行は問題なく実行されました

しかしWebブラウザ(firefox)からjavascriptを呼び出し、そこからphpを呼び出して実行すると
system('execのフルパス');
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この行以降が実行されていないようです

直接phpを実行した場合と、外からブラウザで呼び出した場合では何か制限みたいなものがあるのでしょうか？