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PHPが「おかしい」というより、それは言語の特性。
プロセスが複数生成され、それに伴って当然メモリ空間がバラバラになる。
サイト全体で共有できるメモリ空間がない。
シングルトンが本来の意味をもたないのは当たり前。

こういう特性だからPHPはJavaに比べると特にDBを使うサイトでは設計が難しい。
DBから取ってきたデータをキャッシュできないからDBへの負荷もかかる。
圧倒的に不利。OpenPNEやWordPressが激重なのも当然。

その特性（欠点）を補うためにはmemcachedという汎用の
メモリキャッシュシステムを入れるとなんとかならないこともない。

しかし、言語レベルでサイト全体のメモリサポートがあるJavaと比べると
使い勝手が悪いのは間違いない。