そもそも<?が重複して問題になるケースってある?
xmlとphpが混在してかつパースする必要があると思う訳だが
俺が想像できるのは
1.PHPのエディタ
2.デザインのソフト
3.PHP自身
これくらいで、全て問題にならん上にそんな状況も発生しない