>>501のソース
最初ファイルの書き出しの所でオーバーヘッド起きてるんだと信じ込んでたが
$file=$_POST['FILE'];
の直後に、echo 'OK';exit();
やっても、OKが返るまでに相当時間がかかる。
さらに、$file=直前の一行目に書いても同じ。

ちなみに、俺はWindows版のPHPで試したが、その場合PHP4/5ともに30秒くらいかかった。
んで、FreeBSDマシンもあるので、>>501とほぼ同じマシンで試したら、4/5ともにほぼ同じ30秒くらい。

ところがどっこい、xreaのPHP5採用鯖とPHP4採用鯖で試したら、2秒で完了した。
同じく外部で借りてる鯖で試してもそんなもん。
この2つの共通点はLinuxって事だな。

俺の結論としては、4/5の差じゃなくて、OSの何かの差だと思うんだが・・・。
PHP.iniファイルは当然あわせてるし、他に考えられん。