cloneとかあの辺はβから正式リリースまでにかなり仕様が変わったからね。
なんせ、本家Zendのサンプルコードですら修正されてなくて間違ったままになってるくらいｗ
赤マンモス本でも初版では旧仕様のコードで説明されてたりした。

PHP5でのオブジェクト代入の動きの説明に関してはここなんてどう？
ttp://www.shigeweb.jp/php/project_p/?section=php5oop&page=substitution
> 「$agent_hodenasu = $hodenasu;」の結果、「変数$agent_hodenasu」が、
> PHP4では代入元のオブジェクトのクローン（コピー）になっていたのに、
> PHP5ではリファレンスの様な、でも違う代理人の様なものになったなぁという事を理解できたと思います。
> でも実際はリファレンスです（え？）。「変数$agent_hodenasu」は「変数$hodenasu」のリファレンスですが、
> 完全なリファレンスではないのです。