うん。ソース読んでみたんだけど、どうやらメンテナンス中のindex.phpのソースにはテーマの.cssが反映されていない
ということまでわかった。「このサイトはただいまメインテナンスです」というキーワード
でググってみたところ一件だけ改良を加えてあるサイトを発見する
http://inakakurashi.net/
何もいじってないメンテ中ページと上記メンテ中サイトのソースを見くらべてみた
俺と同じ通常だと
<link rel="stylesheet" type="text/css" media="all" href="http://www.hoge.net/xoops.css" />
という記述だけだが、上記サイトにはさらに
<link rel="stylesheet" type="text/css" media="screen" href="http://www.hoge.net/themes/hoge/style.css" />
という新たに追加された記述があることまではわかった。
しかし、どの部分をいじってその一行を付け加えたのかがわからん。

という結果がでました。ヘルプ（涙