俺の場合、単純なのなら
>ファイルオープン→読む→出力→ファイルクローズだと思うけど。
これと同じようにしてる。
ただ、やや複雑になってきたりするとやっぱプログラム内で生成する。
ループでテーブル生成、ってのを多用するから。

ヒアドキュメントは、絶対左側に書くって規則があるから使わない。
しかもヒアドキュメントだと状況によって細かく出力を変えれないからあんま使い道ない気が…。
ヒアドキュメント使うなら外部にHTMLを書いたtxtを置くかな。

>別ファイルということは、やっぱりrequire文でhtmlを出力するためのスクリプトを
>呼び出すということでしょうか?
プログラム内でHTMLを生成する必要がある上、あまりに縦長で邪魔になった時は、
こーゆーのも作った事あるよ。俺は。