スクリプトごとに設定ファイルを作ったほうがいいと思うんだけど、どう?
板ごとに"setting"ディレクトリを作って

read.txt #read.cgi用
r.txt #r.i用
p.txt #p.i用

ページの設定をもっと細かく出来るようにbbs.cgi設定ファイル
i.txt #i/index.html用
index.txt #index.html用
subback.txt #subback.html用

2chブラウザで必要な設定は今のままSETTING.TXT

2chだとココまで汎用にする必要はないけど、配布するようなスクリプトだと
ココまでやってもいいと思うんだけど。