Acrobat起動してPDF加工しようがなにしようが、
それ自体がアドビとのライセンス上問題なく、かつ客に対するビジネスとしても問題なければ、
技術的な個人趣味とか嗜好とかを除けば何ら問題ないんじゃないの。
WOと絡めようがなんだろうが、関係ないと思うが。

そういやライセンス的にはどうなんだ？プ社の場合は。