とりあえずserver.xmlは元に戻してみたら。書かなくても動くし。
てゆうかwebappsの直下に前バージョンで動いていたヤツをjarで固めて置いて置けばいいじゃん。
Tomcatが起動時に勝手に解凍して配置してくれるんだから。