>もしかしてApacheと連携させてない?
Tomcatは、Apacheと連携させています。

私の発言の趣旨は、Tomcatの起動が遅い、という
ことではありません。ある程度の大きさのアプリケー
ションであれば、起動時間が長くかかるのは当然です。
それなのに、perl-CGIの起動時間だけ、なぜ短いのかが
不思議に思い、質問したわけです。本当に、CGI-perl
は、毎回、perlを起動して、perlスクリプトをコンパイル
しているのでしょうか?