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ホストの設定の拡張タブにあるPASVモードを使うにチェックマークを付けます。
ホストに接続しなおし、表示メニューの最新の情報に更新を行なってください。

ホストの設定の高度タブにあるLISTコマンドでファイル一覧を取得にチェックマークを付けます。
ホストに接続しなおし、表示メニューの最新の情報に更新を行なってください。

（解説）
FFFTPはファイル一覧を取得するために、"NLST -alL"コマンドをホストに送っています。このコマンドに対応していないホストに接続する時は、"LIST
"コマンドを使います。

このヘルプに書いてある通りにやってみてはいかがでしょうか？
ちなみに、バージョンは1.88aです。