SCAとは？SCSIのことですよね？
AT-LINKの価格設定とかは知らないですが、
忙しいサーバーなら差は確実に出ますよ。
ヒマなサーバーならほとんど差はありません。
月額利用料にどれくらい差があるのかわかりませんが、
多分、SCSIを入れる＝忙しいサーバー＝転送量が多い
という仮定で価格を高くしてるのかも知れませんね。