主なパーツをざっと見つもってみました。
USER'S SIDE(注:価格の載っていたものをチョイス)
ttp://www.users-side.co.jp/index.php

SuperMicro X5DA8 \86,800
Xeon 2.40B GHz \28,980
Registered ECC DDR-SDRAM 1GB*2 \34,180*2=\68,360
Seagate Cheetah 15k rpm*2 \34,980*2=\69,960
Adaptec 29320 Ultra320 SCSI Card \41,480
小物は無視してこれだけで,\295,580…

マザボをX5DPAGGにしてみると \51,800なので\35,000マイナス
それでも\260,580…
道は長そうです…