皆さん、ハードウェアはPCでやっておられるようですが、
何か適当なワンボードマイコンでLinuxを動かすことは出来ないでしょうか?

そんなにシビアなリアルタイム制御でなく、msecで十分な環境です。
手のひらに載る程度のサイズで、コンパクトフラッシュが1〜2枚載ると嬉しいです。

Foxプロジェクトとかhttp://ip-sol.jp/h8max/が有名だと思われますが、
あとは、別の意味で有名なモルフィーワンとか・・・

他に、何かご存知の方はいらっしゃいますか?